Iwane SHIBURA, jeune garçon de 18 ans vivant à Tokyo n’est pas un jeune homme comme les autres. En effet il a la particularité d’avoir les yeux jaunes ce qui lui vaux plusieurs moqueries de la part de ses camarades classes en élémentaire.
Le jour de sa rentrée à l’université, en arrêtant un voleur avec ses amis, il fait la rencontre d'un vieil homme qui semble en savoir beaucoup sur la signification de la couleur de ses yeux. En effet il découvre qu’il est l'incarnation du Roi noir du jeu d'échecs qui se joue à taille réelle avec de vrai humains et qu'il existe un autre Roi qui cherche à le mettre en échec. Suite à ça, Iwané se retrouve à devoir défendre les siens dans un jeu où chaque action peut être la dernière...